.Organización 
Estructura organizativa
La estructura organizativa de la Cátedra requiere estar en consonancia con el carácter abierto, libre y dialogante que pretende este espacio, sin dejar de ser profundamente académico y universitario. Este esquema además aporta peso intelectual al proyecto y abre mayores posibilidades de gestión.
Las tres instancias de conducción de la Cátedra son las siguientes: Consejo de Honor; Consejo Académico y Coordinación General.
El coordinador general es nombrado por el Consejo de Honor. Las funciones del coordinador general son las siguientes: 1) representar legalmente a la Cátedra y responder judicialmente por ella en caso de que sea necesario; 2) coordinar la organización y la ejecución de todas las actividades de la Cátedra; 3) elaborar el plan de trabajo anual en conjunto con el Consejo Académico; 4) someter a discusión y ratificación de las instancias internas o de las instancias universitarias respectivas los casos o asuntos que fuere necesario para que la Cátedra funcione plenamente; 5) gestionar la donación de recursos para garantizar la ejecución del plan de trabajo anual; 6) administrar los recursos que pertenezcan a la Cátedra. El actual coordinador general fue nombrado por el Consejo de Honor en noviembre de 2008, se trata del poeta Pablo Benítez, quien además es el fundador de la Cátedra.
Estatuto legal
Para efectos legales e institucionales, la Cátedra Libre Roque Dalton cuenta con el apoyo institucional y académico del Instituto de Estudios Históricos, Antropológicos y Arqueológicos de la Universidad de El Salvador. Este apoyo no obstaculiza o limita en modo alguno el radio de actividades de la Cátedra al campus central o a las sedes regionales de la Universidad de El Salvador. Tampoco impide que la Cátedra tenga su propio carácter jurídico nacional.
Componentes y ejes temáticos
La Cátedra posee tres componentes de trabajo: investigación; divulgación y acervos documentales. En el contexto de cada uno de estos tres componentes, se desarrollan programas de trabajo vinculados a los siguientes ejes temáticos: literatura, ciencias sociales, política y debates universitarios.
- Cartelera
Una propuesta de bioética pública
Seminario Nacional de Bioética
Conservando la memoria
Taberna y otros lugares: 40 años
- Bitácora de Roque Dalton
Dalton: un corazón aventurero
El ciervo perseguido
La roca donde Roque murió
Al borde del abismo
Sobre un poeta poco conocido
- Palabras del Consejo de Honor
Eduardo Galeano
Immanuel Walerstein
Salvador Moncada
Thelma Nava
Juan Gelman
